1. Администрация (главный врач, его заместители)
  2. Приёмное отделение
  3. Отделение реанимации и интенсивной терапии;
  4. Инфекционные боксированные отделения
    • 1-е отделение
    • 2-е отделение
    • 3-е отделение
    • 4-е отделение
    • 5-е отделение
  5. Отделение лучевой диагностики
  6. Амбулаторное отделение с дневным стационаром
  7. Лечебно-диагностические кабинеты:
    • функциональной диагностики
    • гинекологический
    • хирургический
    • динамического наблюдения и реабилитации реконвалесцентов острых инфекционных заболеваний (острые вирусные гепатиты)
  8. Лабораторная служба:
    • бактериологическая лаборатория
    • клинико-диагностическая лаборатория
    • микробиологическая лаборатория (лаборатория иммуноферментных методов и молекулярно-генетической диагностики)
  9. Организационно-методический отдел
  10. Эпидемиологический отдел
  11. Клинико-экспертный отдел
  12. Вспомогательные подразделения и параклинические службы